Che cosa è 2D gel elettroforesi?

Bidimensionale elettroforesi su gel (2D) è un metodo gli scienziati utilizzano per smontare e analizzare miscele di proteine ​​per la prima separazione bande di proteine ​​lungo due assi differenti. Si tratta di una tecnica che viene spesso utilizzato quando si tratta di miscele complesse di proteine ​​o spessi, spesso con dimensioni di proteine ​​sovrapposizione. Elettroforesi su gel 2D differisce da elettroforesi su gel monodimensionale perché il primo metodo impiega separazione delle proteine ​​basato su due diverse caratteristiche proteiche, considerando gel elettroforesi monodimensionale solito separa proteine ​​basate su un'unica caratteristica, come la dimensione proteine.

Gel elettroforesi è spesso usato nella ricerca per separare molecole sfruttando il fatto che molte molecole biologiche, come il DNA, hanno una carica elettrica. Questo fatto può essere utilizzato per il vantaggio di scienziati perché molecole cariche possono essere separati da dimensioni attraverso un substrato poroso come agarosio applicando un gradiente di tensione attraverso un porosa, gel ionico. Nel corso del tempo, molecole passeranno attraverso questo gel, verso la carica che è opposta alla carica naturale della molecola. Piccole molecole e molecole fortemente cariche entrambe si muovono più velocemente rispetto alle grandi molecole o proteine ​​che sono debolmente caricate. In elettroforesi su gel 2D, dopo separazione delle proteine ​​attraverso un'unica caratteristica, che crea un gradiente, un gel può essere ruotata lateralmente per separare dette bande precedentemente risultanti basato su una seconda caratteristica.

Elettroforesi su gel 2D spesso impiega accuse molecolari di proteine, come una caratteristica per cui aggregati proteici possono essere separati in proteine ​​componenti singoli. Massa proteica è un'altra caratteristica comune utilizzato per separare le proteine ​​in elettroforesi su gel 2D. Dopo proteine ​​vengono eseguiti su un gel attraverso una singola corsia in unidimensionale elettroforesi in gel, il gel che può essere filata in una centrifuga, tirando le proteine ​​più pesanti più velocemente rispetto alle proteine ​​più piccole, meno voluminosi. La direzione della trazione è perpendicolare alla direzione di proteine ​​sono stati elaborati attraverso il gel a causa di attrazione per una carica elettrica attraverso un gradiente di tensione.

Elettroforesi ha molti usi in studi molecolari, tra cui la separazione delle proteine ​​in base alle caratteristiche di sintesi, come la proteina tagging. Protein separazione basata su una massa caratteristica viene utilizzata anche quando le proteine ​​sono contrassegnati con altre molecole. Questa tecnica può essere utilizzata con questi complessi proteici perché le proteine ​​taggati cadranno più facilmente attraverso un gel di proteine ​​senza tag.

Mentre molti gel di separazione in laboratorio sono in agarosio, separazione delle proteine ​​mediante elettroforesi su gel 2D è meglio farlo su gel di poliacrilammide. Questi tipi di gel sono utilizzati in Western Blot e altri saggi proteina-size base. Agarose è più spesso usato per la separazione di segmenti di DNA.